Forskningsområder
Museets forskning er koncentreret om følgende områder:
Entomologi, ferskvandsøkologi, jordbunds-biologi, kulturlandskabets økologi, faunistik samt bioakustik.
Museet er medlem af Det Rådgivende Forskningsudvalg for Naturhistorisk Museum og Statsbiblioteket. Udvalget er nedsat af Kulturministeriets Forskningsudvalg med repræsentanter fra Statens Naturvidenskabelige Forskningsråd og Statens Humanistiske Forskningsråd. Museet afrapporterer hertil årligt og fremlægger forskningsplaner.
Museets samlinger
Størstedelen af museets samlinger opbevares i magasiner med for eksempel skeletter, skind af fugle og pattedyr, skaller af snegle og muslinger, præparerede insekter og så videre. Kun en mindre del findes i udstillingerne.
Samlingerne bruges i forskningen i forbindelse med feltundersøgelser, som mest foregår i Danmark.